Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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C4orf47A7E2U8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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C4orf47A7E2U8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C4orf47A7E2U8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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C4orf47A7E2U8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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C4orf47A7E2U8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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C4orf47A7E2U8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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C4orf47A7E2U8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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C4orf47A7E2U8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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C4orf47A7E2U8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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C4orf47A7E2U8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf47A7E2U8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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