Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPDYE4A6NLX3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPDYE4A6NLX3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms