Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RGPD3A6NKT7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms