Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEMP2A6NFY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEMP2A6NFY4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEMP2A6NFY4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms