Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD3L3A6NE82 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms