Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6BA6NDN3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms