Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms