Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMF1-BGLAPU3KQ54 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMF1-BGLAPU3KQ54 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms