Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clcn5Q9WVD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clcn5Q9WVD4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clcn5Q9WVD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clcn5Q9WVD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clcn5Q9WVD4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Clcn5Q9WVD4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clcn5Q9WVD4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clcn5Q9WVD4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms