Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GMEB2Q9UKD1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GMEB2Q9UKD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GMEB2Q9UKD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GMEB2Q9UKD1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GMEB2Q9UKD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GMEB2Q9UKD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GMEB2Q9UKD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms