Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCN11AQ9UI33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCN11AQ9UI33 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCN11AQ9UI33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCN11AQ9UI33 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCN11AQ9UI33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SCN11AQ9UI33 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SCN11AQ9UI33 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SCN11AQ9UI33 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SCN11AQ9UI33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SCN11AQ9UI33 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SCN11AQ9UI33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SCN11AQ9UI33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms