Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNAL1Q9UBT7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTNNAL1Q9UBT7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNAL1Q9UBT7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTNNAL1Q9UBT7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNNAL1Q9UBT7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms