Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC17A6Q9P2U8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC17A6Q9P2U8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC17A6Q9P2U8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC17A6Q9P2U8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC17A6Q9P2U8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC17A6Q9P2U8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC17A6Q9P2U8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms