Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC27Q9NZQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC27Q9NZQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC27Q9NZQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJC27Q9NZQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC27Q9NZQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC27Q9NZQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC27Q9NZQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC27Q9NZQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms