Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYOFQ9NZM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYOFQ9NZM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYOFQ9NZM1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYOFQ9NZM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOFQ9NZM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYOFQ9NZM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOFQ9NZM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYOFQ9NZM1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYOFQ9NZM1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms