Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLN6Q9NWW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLN6Q9NWW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLN6Q9NWW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLN6Q9NWW5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLN6Q9NWW5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLN6Q9NWW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLN6Q9NWW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms