Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTU7

CBLN4, Cerebellin-4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4Q9NTU7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBLN4Q9NTU7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBLN4Q9NTU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBLN4Q9NTU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBLN4Q9NTU7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBLN4Q9NTU7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBLN4Q9NTU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms