Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT84Q9NSB2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT84Q9NSB2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT84Q9NSB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT84Q9NSB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT84Q9NSB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT84Q9NSB2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT84Q9NSB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms