Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLSCR3Q9NRY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLSCR3Q9NRY6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLSCR3Q9NRY6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PLSCR3Q9NRY6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLSCR3Q9NRY6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLSCR3Q9NRY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms