Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BIN3Q9NQY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
BIN3Q9NQY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BIN3Q9NQY0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BIN3Q9NQY0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BIN3Q9NQY0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BIN3Q9NQY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms