Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RTN4Q9NQC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RTN4Q9NQC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RTN4Q9NQC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RTN4Q9NQC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RTN4Q9NQC3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RTN4Q9NQC3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RTN4Q9NQC3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RTN4Q9NQC3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RTN4Q9NQC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RTN4Q9NQC3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms