Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX4

TRPC7, Short transient receptor potential channel 7, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC7Q9HCX4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC7Q9HCX4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPC7Q9HCX4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRPC7Q9HCX4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRPC7Q9HCX4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPC7Q9HCX4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPC7Q9HCX4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRPC7Q9HCX4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPC7Q9HCX4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms