Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EBF3Q9H4W6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EBF3Q9H4W6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EBF3Q9H4W6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF3Q9H4W6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF3Q9H4W6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EBF3Q9H4W6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EBF3Q9H4W6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF3Q9H4W6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms