Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRDM12Q9H4Q4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRDM12Q9H4Q4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM12Q9H4Q4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM12Q9H4Q4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM12Q9H4Q4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM12Q9H4Q4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM12Q9H4Q4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms