Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTDSP1Q9GZU7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTDSP1Q9GZU7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTDSP1Q9GZU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTDSP1Q9GZU7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSP1Q9GZU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTDSP1Q9GZU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms