Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YIPF3Q9GZM5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YIPF3Q9GZM5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YIPF3Q9GZM5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YIPF3Q9GZM5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
YIPF3Q9GZM5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF3Q9GZM5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF3Q9GZM5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms