Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM31Q9BZY9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM31Q9BZY9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM31Q9BZY9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM31Q9BZY9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM31Q9BZY9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM31Q9BZY9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM31Q9BZY9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms