Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms