Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PRXQ9BXM0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PRXQ9BXM0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRXQ9BXM0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PRXQ9BXM0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
PRXQ9BXM0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
PRXQ9BXM0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
PRXQ9BXM0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
PRXQ9BXM0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
PRXQ9BXM0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
PRXQ9BXM0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
PRXQ9BXM0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
PRXQ9BXM0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
PRXQ9BXM0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
PRXQ9BXM0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
PRXQ9BXM0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
PRXQ9BXM0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
PRXQ9BXM0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PRXQ9BXM0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
PRXQ9BXM0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PRXQ9BXM0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
PRXQ9BXM0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
PRXQ9BXM0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.62■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
PRXQ9BXM0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.55■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
PRXQ9BXM0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms