Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHID1Q9BWS9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHID1Q9BWS9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHID1Q9BWS9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHID1Q9BWS9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHID1Q9BWS9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHID1Q9BWS9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHID1Q9BWS9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms