Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YIPF4Q9BSR8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
YIPF4Q9BSR8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YIPF4Q9BSR8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF4Q9BSR8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF4Q9BSR8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF4Q9BSR8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms