Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLF1Q9BQI6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLF1Q9BQI6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SLF1Q9BQI6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SLF1Q9BQI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SLF1Q9BQI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLF1Q9BQI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLF1Q9BQI6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms