Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PMCHL2Q9BQD1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PMCHL2Q9BQD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PMCHL2Q9BQD1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMCHL2Q9BQD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms