Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC6Q99741 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDC6Q99741 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDC6Q99741 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC6Q99741 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDC6Q99741 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC6Q99741 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms