Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NOTCH4Q99466 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOTCH4Q99466 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOTCH4Q99466 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOTCH4Q99466 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOTCH4Q99466 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOTCH4Q99466 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOTCH4Q99466 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOTCH4Q99466 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms