Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE2Q96MF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSMCE2Q96MF7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSMCE2Q96MF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE2Q96MF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE2Q96MF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE2Q96MF7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE2Q96MF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE2Q96MF7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms