Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CNOT6LQ96LI5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNOT6LQ96LI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNOT6LQ96LI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNOT6LQ96LI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNOT6LQ96LI5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNOT6LQ96LI5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNOT6LQ96LI5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNOT6LQ96LI5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNOT6LQ96LI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms