Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPZA3Q96KX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAPZA3Q96KX2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAPZA3Q96KX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPZA3Q96KX2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAPZA3Q96KX2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAPZA3Q96KX2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPZA3Q96KX2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPZA3Q96KX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms