Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms