Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC12Q96J65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC12Q96J65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC12Q96J65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC12Q96J65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC12Q96J65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC12Q96J65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC12Q96J65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC12Q96J65 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms