Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TVP23CQ96ET8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23CQ96ET8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23CQ96ET8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TVP23CQ96ET8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TVP23CQ96ET8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TVP23CQ96ET8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23CQ96ET8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23CQ96ET8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TVP23CQ96ET8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23CQ96ET8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TVP23CQ96ET8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms