Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubl7Q91W67 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubl7Q91W67 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubl7Q91W67 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubl7Q91W67 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubl7Q91W67 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubl7Q91W67 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubl7Q91W67 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubl7Q91W67 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms