Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNE4Q8WWG9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNE4Q8WWG9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNE4Q8WWG9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNE4Q8WWG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNE4Q8WWG9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNE4Q8WWG9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNE4Q8WWG9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNE4Q8WWG9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNE4Q8WWG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNE4Q8WWG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNE4Q8WWG9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNE4Q8WWG9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms