Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC19

Alas1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas1Q8VC19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Alas1Q8VC19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alas1Q8VC19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alas1Q8VC19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alas1Q8VC19 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Alas1Q8VC19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Alas1Q8VC19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Alas1Q8VC19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Alas1Q8VC19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alas1Q8VC19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms