Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
USP32Q8NFA0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
USP32Q8NFA0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
USP32Q8NFA0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.57
USP32Q8NFA0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
USP32Q8NFA0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
USP32Q8NFA0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
USP32Q8NFA0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.53
USP32Q8NFA0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
USP32Q8NFA0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms