Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMPERQ8N8U9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMPERQ8N8U9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BMPERQ8N8U9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMPERQ8N8U9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BMPERQ8N8U9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BMPERQ8N8U9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BMPERQ8N8U9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BMPERQ8N8U9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BMPERQ8N8U9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BMPERQ8N8U9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms