Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MS4A15Q8N5U1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A15Q8N5U1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A15Q8N5U1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A15Q8N5U1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A15Q8N5U1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A15Q8N5U1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms