Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q8CDS7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDS7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDS7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q8CDS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDS7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDS7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CDS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CDS7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CDS7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CDS7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CDS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CDS7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8CDS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8CDS7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q8CDS7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8CDS7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms