Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FAM228AQ86W67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FAM228AQ86W67 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAM228AQ86W67 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM228AQ86W67 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM228AQ86W67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM228AQ86W67 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.9 ms