Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2H8

SLC36A1, Proton-coupled amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A1Q7Z2H8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A1Q7Z2H8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC36A1Q7Z2H8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC36A1Q7Z2H8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC36A1Q7Z2H8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms