Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COPS6Q7L5N1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COPS6Q7L5N1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
COPS6Q7L5N1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COPS6Q7L5N1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COPS6Q7L5N1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
COPS6Q7L5N1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COPS6Q7L5N1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COPS6Q7L5N1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms